A partir de las reformas a las leyes, son diversos los desafíos que deberán enfrentar los gobiernos regionales, principalmente derivados de sus nueva estructura administrativa con nuevas funciones, atribuciones y una estructura organizacional más amplia, con nuevas divisiones, unidades y cargos; que se suman a las tres clásicas divisiones de planificación y desarrollo regional, de presupuesto e inversión regional y la de administración y finanzas.

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